1.根部溫度管理
作物根系生長(zhǎng)和吸收養(yǎng)分的適宜溫度一般在18～25℃之間，冬季當(dāng)室溫降到15℃左右時(shí)，基質(zhì)栽培中的溫度也降到13～15℃，由于根系生長(zhǎng)并不需要溫差，溫度過低很快影響根系活力，導(dǎo)致蔬菜生長(zhǎng)緩慢和葉片黃化；夏天當(dāng)室溫達(dá)35℃甚至更高時(shí)，的溫度就會(huì)超過30℃，引起根系呼吸過于旺盛而缺氧，并迅速引起根系和植株莖葉的衰老。
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2.基質(zhì)隔離保護(hù)
基質(zhì)栽培為了提高保水、保肥能力，一般都應(yīng)有保護(hù)基質(zhì)和根系的容器，槽式及溝式培也必須用薄膜隔離土壤，以免根系扎入土中和引起水肥滲漏。但為了防止根部積水，底部需要保留少量排液孔，還要考慮廢液的回收利用，以免造成地下水的硝酸鹽污染。
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基質(zhì)表面不覆蓋（保濕），夏秋高溫季節(jié)很容易引起表面的鹽分積累和引起藻類滋生，進(jìn)而引起根部透氣不良。有機(jī)生態(tài)型無(wú)土栽培和常規(guī)敞開槽式基質(zhì)栽培都存在鹽分積累問題，應(yīng)該采用具隔熱并保濕的材料覆蓋根基表面。
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3.供液設(shè)施
基質(zhì)栽培一般都采用滴灌供液，由于北方水質(zhì)鈣鎂離子含量高，加上營(yíng)養(yǎng)液本身的多種礦物質(zhì)離子的存在，生產(chǎn)上容易出現(xiàn)滴灌設(shè)施堵塞現(xiàn)象，尤其是微孔滴管設(shè)施，堵塞的頻率就更高。